Indy befreit seinen Vater und erfährt gleichzeitig, dass Donovan und Schneider für die Nazis arbeiten. Die Nazis haben Marcus in Alexandretta entführt und stehlen nun auch das Tagebuch. Nach einer Verfolgungsjagd können Jones junior und senior die wertvollen Aufzeichnungen vor einer Bücherverbrennung in Berlin retten und reisen nach Alexandretta, wo sie den alten Freund Sallah treffen. Nun müssen sie die Nazis auf dem Weg zum Gral stoppen.

Die Jagd mit einem Panzer und Pferden endeten vor dem Gralstempel in der Schlucht des Halbmondes. Dort schießt Donovan Henry an, so dass Indy gezwungen ist, den gefährlichen, mit mehreren Fallen gesicherten Weg ins Innere des Tempels zu gehen. Er kniet vor Sägen nieder, betritt Felder mit den Buchstaben des Namens Iehovah und überquert eine unsichtbare Brücke, bis er schließlich beim alten Gralsritter ankommt.

Donovan und Schneider sind ihm gefolgt und wollen zuerst einen der vielen Kelche ausprobieren. Der machtsüchtige Donovan entscheidet sich für einen prunkvolles Exemplar und zerfällt zu Staub. Indy wählt hingegen den bescheidenen Becher eines Zimmermanns. Damit rettet er seinen Vater. Aber weil eine Grenze überschritten wurde, stürzt der Tempel ein. Gerade rechtzeitig können sich Indy und Henry mit ihren Freunden retten.